حصلت كلية الزراعة على جائزة الدولة التقديرية لعام 2006 كما حصلت أقسامها وأعضاء هيئة التدريس فيها على العديد من الجوائز العلمية والتقديرية من مؤسسات محلية وعربية ودولية، كان آخرها فوز قسم التغذية والتصنيع الغذائي في كل من جائزة الحسن بن طلال للتميز العلمي للعام 2009 وجائزة المركز العربي للتغذية لعام 2008 كأفضل مؤسسة تعليمية في الوطن العربي.