يعتبر قسم وقاية النبات من أقدم أقسام الكلية حيث تم إنشاؤه عام 1973 تحت اسم قسم الإنتاج النباتي والوقاية إلى أن تم فصل القسمين في 1/7/1980 وأصبح القسم تحت اسم قسم وقاية النبات. ولكن بموجب الهيكلة منذ مطلع العام الجامعي 1997/1998 تم ضم القسم إلى البستنة تحت اسم قسم البستنة ووقاية النبات، وذلك لغاية نهاية العام الجامعي 2001/2002م، وقد باشر القسم أعماله من جديد بعد انفصاله عن قسم البستنه في مطلع العام الجامعي 2002/2003 تحت اسم قسم وقاية النبات ثانية. يلعب القسم دوراً رئيسيا في الناحية التعليمية والبحثية حيث أثمرت العملية التعليمية بتميز خريجيها في مراحل البكالوريوس والماجستير والدكتوراه، حيث يتولون مناصب مهمة في الدوائر الحكومية أو الخاصة سواء في الأردن أو في الخارج. وأما من الناحية البحثية فقد تم نشر عدد كبير من الأوراق العلمية في مجالات الأمراض والحشرات والأعشاب في مجلات عالمية ومحلية محكمة. كما يتميز بدوره الهام في الناحية الإرشادية وتقديم الخدمات للمؤسسات الزراعية سواء الحكومية منها أو الأهلية وكذلك مزارع الأفراد والحدائق بأنواعها من خلال تعريف الإصابات الحشرية والمرضية والأعشاب الضارة واقتراح أنجح الوسائل لمكافحتها . يضم القسم مختبرات مجهزة، ومنحلا، ومتحفا يحوي آلافا من العينات الحشرية وكل هذه المرافق تخدم العملية التدريسية والبحثية لأعضاء هيئة التدريس وطلبة الدراسات العليا وطلبة البكالوريوس. أعضاء هيئة التدريس في القسم جميعهم يحملون درجات الدكتوراه، حيث تخرجوا من جامعات مختلفة ومن دول مختلفة في تخصصات الوقاية النباتية المختلفة بالإضافة إلى موظفين يحملون درجة البكالوريوس، يعملون كمشرفين للمختبرات ومحضر مختبر واحد، وجميعهم يخدمون العملية التدريسية والأبحاث الجارية في القسم.
يتطلع قسم وقاية النبات الى ان يصبح في مصاف مراكز الامتياز التي تحقق رسالته في تحسين نوعية الحياة للسكان في الاردن والعالم، آخذا بعين الاعتبار التطورات العلمية الحديثة التي تخدم ادارة الآفات من اجل تحسين الزراعة. ويهتم القسم في تطوير خبراته باستقطاب العلماء المتميزين للالتحاق به ضمن الامكانيات المتاحة. وعليه فان القسم سيكون احد مراكز الجامعة التي تقوم بما يلي:
1- تطوير مقاييس النوعية في التعليم في جميع برامجه التعليمية
2- دعم جميع العاملين فيه بالحصول على التدريب في المجالات المختلفة
3- استحداث برامج علمية تخدم ادارة الآفات في المجتمعات الانسانية المختلفة
تهدف رسالة قسم وقاية النبات في الجامعة الاردنية الى تزويد طلبته بتعليم نوعي عال، والى قيام أعضائه بإجراء ابحاث على الآفات المختلفة ( الحشرات وامراض النبات والاعشاب)، وتطوير طرق مناسبة لإدارتها، وتقديم استشارات علمية دقيقة للقطاع الزراعي في الاردن والعالم.
يتضمن مجال وقاية النبات حقولا علمية متداخلة ، ولهذا فان القسم يضم عددا من العلماء في مجالات الحشرات والحلم والبكتيريا والفطريات والنيماتودا والفيروسات والأعشاب . يهتم اعضاء القسم بحماية المحاصيل من الآفات آخذين بعين الاعتبار الحفاظ على البيئة. ويجري عدد منهم ابحاثا حول الآفات الطبية والمنزلية والبيطرية. كما يهتم القسم بتوطيد التعاون مع الاقسام الاخرى في الكلية و في داخل الجامعة وخارجها في المجالات العلمية المختلفة. وتعتبر السمعة الدولية للقسم من أهم مصادر انجذاب الطلية اليه.
ان التدريس في قسم وقاية النبات - على مستوى البكالوريوس والدراسات العليا - من انشطة القسم الاساسية. وبهذا فانه يهتم بتطوير وسائل التدريس بأحدث الطرق المتاحة في العالم واثراء امكانياته المختلفة من أجل تزويد طلبته بالخبرات والمهارات اللازمة للنجاح في مساعيهم العلمية، و تأهيل خريجيه للعمل في المؤسسات الزراعية الحكومية والخاصة في مجال مكافحة الآفات. و العمل في الجامعات والمعاهد العلمية وفي مراكز الابحاث لتطوير تكنولوجيا الزراعة في المستقبل. وتمكينهم من انشاء مشارعيهم الخاصة.
- مستوى متقدم في صحة النبات.
- بدء مهنة جديدة في المجال المهني المختار في صحة النبات.
- تحسين مكانة الطلاب النسبية في مجال تنافسي وسوق عمل مليء بالتحديات.
- إعداد الطلاب لمتابعة مستوى الدكتوراه في صحة النبات.